paulkuo.tw · 开放学习工具
AlphaFold 学习中心
主题 01 · 肌少症网络 更多主题陆续新增
一个边学边做的 AlphaFold 学习空间。跟着 30 天计划走，每弄懂一个蛋白质，就在站上留下一张活的结构卡：结构实时抓自公开数据库、依 pLDDT 置信度上色，并清楚区分哪些是已知事实、哪些只是模型预测。学过的蛋白质永久保留、持续累积；你可以照同一套流程往下做，也可以直接浏览已经整理好的结构。
互动学习中心起手题：Myostatin / ActRIIB / Follistatin弹性推进
已知事实实验或数据库可查证
模型预测AlphaFold 给的结构假说
合理推论由前两者推导、尚未证实
待验证假说需要实验确认
每一格产出都要标清楚落在上面哪一层。这是整份计划的核心原则，也会是站上每张卡的固定字段。
00
速查任意蛋白质
输入名称、基因或 UniProt 编号 · 实时生成基本结构卡数据实时取自 UniProt 与 AlphaFold DB；速查卡只列公开事实与模型预测，未经人工策展。
01
30 天弹性追踪器
勾选与目标存在本地浏览器 · 可跳关 · 目标可自定义 0% 0 / 30
02
蛋白质书柜
学过的留在这里 · 日后可持续新增03
活结构卡 · Myostatin
3D 结构实时抓自 AlphaFold DB · 依 pLDDT 上色pLDDT 置信度
很高 > 90
可信 70–90
偏低 50–70
很低 < 50（常为无序区）
正在从 AlphaFold DB 加载 AF-O14793-F1…
每张结构卡都可比对 PDB 实验结构，并接进下方的交互作用网络与上方的蛋白质书柜。
04
核心概念小抄
点开看定义 · 对应站上 ConceptExplainer05
肌少症蛋白质网络
Myostatin 已建 · 其余为待建节点 交互作用 / 信号 抑制 点节点：实心＝已建卡，虚圈＝待建
06
假说模板
第三周产出用 · 逼自己分清事实与推论已知证据UniProt / PDB / 文献可查证的部分
结构观察从 AlphaFold 结构看到什么（含 pLDDT / PAE 判读）
合理推论由上述推导、但尚未证实的想法
尚需验证哪一步还缺实验或结构证据
可行实验具体可提给研究者的验证方式
这个工具会怎么长：进度与笔记之后会绑定账号、跨设备同步；每张结构卡接进站上的知识星图，蛋白质书柜随着学过的题目持续累积；并自动追踪标的蛋白的最新论文，让内容与研究同步更新。
结构数据：AlphaFold DB（EMBL-EBI／DeepMind，CC BY 4.0）· UniProt（CC BY 4.0）· PDB。AlphaFold 提供的是结构假说，不等于实验证据。