paulkuo.tw · 開放學習工具
AlphaFold 學習中心
主題 01 · 肌少症網絡 更多主題陸續新增
一個邊學邊做的 AlphaFold 學習空間。跟著 30 天計畫走，每弄懂一個蛋白質，就在站上留下一張活的結構卡：結構即時抓自公開資料庫、依 pLDDT 可信度上色，並清楚區分哪些是已知事實、哪些只是模型預測。學過的蛋白質永久保留、持續累積；你可以照同一套流程往下做，也可以直接瀏覽已經整理好的結構。
互動學習中心起手題：Myostatin / ActRIIB / Follistatin彈性推進
已知事實實驗或資料庫可查證
模型預測AlphaFold 給的結構假說
合理推論由前兩者推導、尚未證實
待驗證假說需要實驗確認
每一格產出都要標清楚落在上面哪一層。這是整份計畫的核心原則，也會是站上每張卡的固定欄位。
00
速查任意蛋白質
輸入名稱、基因或 UniProt 編號 · 即時生成基本結構卡資料即時取自 UniProt 與 AlphaFold DB；速查卡只列公開事實與模型預測，未經人工策展。
01
30 天彈性追蹤器
勾選與目標存在本機瀏覽器 · 可跳關 · 目標可自訂 0% 0 / 30
02
蛋白質書櫃
學過的留在這裡 · 日後可持續新增03
活結構卡 · Myostatin
3D 結構即時抓自 AlphaFold DB · 依 pLDDT 上色pLDDT 可信度
很高 > 90
可信 70–90
偏低 50–70
很低 < 50（常為無序區）
正在從 AlphaFold DB 載入 AF-O14793-F1…
每張結構卡都可比對 PDB 實驗結構，並接進下方的交互作用網絡與上方的蛋白質書櫃。
04
核心概念小抄
點開看定義 · 對應站上 ConceptExplainer05
肌少症蛋白質網絡
Myostatin 已建 · 其餘為待建節點 交互作用 / 訊號 抑制 點節點：實心＝已建卡，虛圈＝待建
06
假說模板
第三週產出用 · 逼自己分清事實與推論已知證據UniProt / PDB / 文獻可查證的部分
結構觀察從 AlphaFold 結構看到什麼（含 pLDDT / PAE 判讀）
合理推論由上述推導、但尚未證實的想法
尚需驗證哪一步還缺實驗或結構證據
可行實驗具體可提給研究者的驗證方式
這個工具會怎麼長：進度與筆記之後會綁定帳號、跨裝置同步；每張結構卡接進站上的知識星圖，蛋白質書櫃隨著學過的題目持續累積；並自動追蹤標的蛋白的最新論文，讓內容與研究同步更新。
結構資料：AlphaFold DB（EMBL-EBI／DeepMind，CC BY 4.0）· UniProt（CC BY 4.0）· PDB。AlphaFold 提供的是結構假說，不等於實驗證據。